O Rio Amônia banha o estado do Acre e localiza-se no município de Marechal Thaumaturgo. Nasce em território peruano e deságua no Rio Juruá.

​

Nas terras baixas encontra-se a Reserva Extrativista do Alto Juruá, enquanto que na parte alta localiza-se a Terra Indígena Kampa do Rio Amônia, do povo indígena Ashaninka.